После визита к шаману племени тоба в Аргентине Ганнибал Лектер вместе с Клариссой попадает в Коноху до момента начала основной истории в манге. Обнаруживает в себе способности к манипуляции чакрой. Его способности - гендзюцу(на основе гипноза), тайдзюцу (владение ножом и высокая физическая сила), регенерация на основе поедания противника(кушая человеческую плоть Ганнибал излечивается), менталистика(техника внутреннего дворца - при попытке считать сознание любой попадает в дворец, где Ганнибал полностью все контролирует).
В момент попадания - Ганнибала задерживает АНБУ и доставляет для допроса к Морики Ибино, где при попытке считать его мысли погибает штатный менталист из клана Ино. После чего ему ставят ультиматум - работу на Коноху или смерть. Он соглашается. В ходе работы узнает об Орочимару и технике Эдо Тенсей и загорается мыслью воскресить Мишу(сестру). Сбегает из Конохи к Орочимару. Пытается договориться о воскрешении Миши в обмен на знания из иного мира.